Γεννήθηκε το 1929 στην Πεδινή Ιωαννίνων, ωστόσο το μεγαλύτερο μέρος της ζωής του το πέρασε στην Αθήνα. Τα πρώτα μαθήματα σχεδίου τα πήρε στα Γιάννενα από τον καθηγητή του στο Γυμνάσιο Γιώργο Καζάκο, και ζωγραφικής από τον γνωστό ζωγράφο Κώστα Μαλάμο, στο Ωδείο, επίσης, των Ιωαννίνων. Σπούδασε ζωγραφική στην Ανωτάτη Σχολή Καλών Τεχνών στο εργαστήριο του Γιάννη Μόραλη (1950-1955) και συνέχισε τις σπουδές του στην Accademia di Belle Arti (1956) της Φλωρεντίας. Παράλληλα, σπούδασε ζωγραφική και αποκατάσταση αρχαιοτήτων στο Instituto Centrale del Restauro (1958-1962) της Ρώμης.
Το 1957 πήρε μέρος στο Παγκόσμιο Φεστιβάλ της Μόσχας, το 1959 στην Μπιενάλε των Νέων στο Παρίσι και από τότε δε σταμάτησε να ζωγραφίζει. Η καλλιτεχνική του δημιουργία χαρακτηρίζεται από τη λιτότητα και τις προσωπικές του αφαιρετικές τάσεις: στη σύνθεση, στο γυναικείο γυμνό, στο πορτρέτο, τις νεκρές φύσεις και το τοπίο,
Παράλληλα με το ζωγραφικό του έργο, εργάστηκε στο υπουργείο Πολιτισμού ως υπεύθυνος καλλιτέχνης συντηρητής και επιθεωρητής συντήρησης, με σημαντική προσφορά στη διάσωση και αποκατάσταση μνημείων και πολύτιμων έργων τέχνης.
Η κηδεία του θα γίνει την Καθαρά Δευτέρα, στις 12 το μεσημέρι, στον Ιερό Ναό Κοίμησης της Θεοτόκου στην Πεδινή.
Έφυγε από τη ζωή ο γιαννιώτης ζωγράφος Στ. Μπαλτογιάννης
Σε ηλικία 90 ετών έφυγε από τη ζωή ο γιαννιώτης ζωγράφος και συντηρητής έργων τέχνης Σταύρος Μπαλτογιάννης.
