Ο Κυπριανίδης, ενώ υπηρετούσε την στρατιωτική θητεία του, τον Μάρτιο του 1961, συμμετείχε με την ομάδα επιλέκτων ποδοσφαιριστών Α’ Εθνικής της ΕΠΟ σε διεθνές τουρνουά ποδοσφαίρου στο Μονπελιέ της Γαλλίας, υπό την αιγίδα της ΟΥΕΦΑ. Όμως η ΕΠΟ έκανε τη χοντρή γκάφα να μην πάρει άδεια από τον στρατό για τον ποδοσφαιριστή, με συνέπεια να κηρυχτεί λιποτάκτης από την μονάδα του. Μόλις γύρισε η Εθνική Επιλέκτων της ΕΠΟ από τη Γαλλία, ο Κυπριανίδης συνελήφθη από τη Στρατονομία (ΕΣΑ) και με διάταξη του στρατιωτικού επιτρόπου προφυλακίστηκε! Αρχές Φεβρουαρίου του 1962 δικάστηκε σε πρώτο βαθμό με διετή φυλάκιση άνευ εξαγοράς. Το εξοργιστικό είναι ότι δεν πήγε κανείς από την ΕΠΟ να υποστηρίξει τον ποδοσφαιριστή, που έμπλεξε σε μια ιστορία χωρίς καμία ευθύνη. Η υπόθεση αυτή πήρε διαστάσεις στον Τύπο της εποχής, καθώς μπήκε φυλακή ένας ποδοσφαιριστής που πήγε να παίξει με κλήση από την ΕΠΟ σε ένα διεθνές τουρνουά, εκπροσωπώντας την Ελλάδα. Η Εθνική Επιλέκτων ήταν τότε όπως είναι σήμερα η Εθνική Ελπίδων. Η διοίκηση του Απόλλωνα Καλαμαριάς έστειλε επιστολή στην ΟΥΕΦΑ και στη ΦΙΦΑ για την τιμωρία του ποδοσφαιριστή. Έτσι σε χρόνο ρεκόρ έγινε η κατ’ έφεση δίκη σε δεύτερο βαθμό από το Αναθεωρητικό Στρατοδικείο Αθηνών, στις 28 Φεβρουαρίου 1962, όπου με παμψηφεί απόφαση ο ποδοσφαιριστής Παναγιώτης Κυπριανίδης αθωώθηκε. Στη δεύτερη δίκη κατέθεσαν ως μάρτυρες υπεράσπισης ο πρόεδρος της ΕΠΟ Αθανάσιος Μέρμηγκας και ο εκλέκτορας των εθνικών ομάδων Κλεάνθης Μαρόπουλος. Η αίθουσα του Στρατοδικείου κατακλύστηκε από φιλάθλους, ενώ παρούσα ήταν και σύσσωμη η διοίκηση του Απόλλωνα Καλαμαριάς. Ο Κυπριανίδης μετά από 9 μήνες στη φυλακή συνέχισε την καριέρα του στον Απόλλωνα Καλαμαριάς που ήταν στην Α’ Εθνική και είχε μεγάλη ομάδα με Μαυρόπουλο, Σφαιρόπουλου, Μεντεκίδη, Αυγητίδη, Κυπριανίδη, Μηταριώτη, Αβραμίδη και άλλους. Το καλοκαίρι του 1963 ο «Καπράν» όπως φώναζαν στην Καλαμαριά τον Κυπριανίδη, μεταγράφηκε στον Ολυμπιακό Πειραιώς. Όλα αυτά, φαντάζουν σήμερα ως παραμύθι, καθώς οι ποδοσφαιριστές υπηρετούν την θητεία τους στο αθλητικό τμήμα των ενόπλων δυνάμεων, κάνοντας ουσιαστικά τίποτα.
ΣΑΝ ΣΗΜΕΡΑ: Η άδικη προφυλάκιση ενός ποδοσφαιριστή
Την Τετάρτη 28 Φεβρουαρίου 1962 το Αναθεωρητικό Στρατοδικείο Αθηνών αθώωσε τον ποδοσφαιριστή του Απόλλωνα Καλαμαριάς Παναγιώτη Κυπριανίδη, ο οποίος σε πρώτο βαθμό από το Στρατοδικείο είχε καταδικαστεί σε διετή φυλάκιση άνευ μετατροπής για λιποταξία από το στράτευμα!
